290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3155 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3155  methyltransferase type 12  100 
 
 		 144 aa  279  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.290736  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3348  methyltransferase type 12  92.91 
 
 		 144 aa  254  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2192  Methyltransferase type 12  61.59 
 
 		 166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5724  methyltransferase type 11  59.57 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1464  Methyltransferase type 12  57.34 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.314215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4711  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1980  Methyltransferase type 12  36.15 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.546163  normal  0.238545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 265 aa  57  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1315  Methyltransferase type 12  32.43 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 269 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 233 aa  53.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 269 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 272 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1375  hypothetical protein  28.04 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4275  methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 236 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 260 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.81 
 
 		 209 aa  52.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.71 
 
 		 215 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  29.08 
 
 		 287 aa  52.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  28 
 
 		 280 aa  51.2  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  29.17 
 
 		 275 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  25.42 
 
 		 208 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 290 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.5 
 
 		 285 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  31.78 
 
 		 258 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.67 
 
 		 254 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  31.01 
 
 		 258 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1153  SAM-dependent methyltransferase  26.17 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.07 
 
 		 251 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2352  hypothetical protein  33.33 
 
 		 335 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  27.48 
 
 		 267 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1987  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 335 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.791499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.48 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  29.84 
 
 		 263 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3168  hypothetical protein  30.95 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  36.64 
 
 		 262 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1413  SAM-dependent methyltransferase  26.17 
 
 		 196 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1147  SAM-dependent methyltransferase  25.23 
 
 		 208 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.07 
 
 		 251 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.07 
 
 		 251 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 285 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.07 
 
 		 251 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  34.35 
 
 		 249 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 240 aa  49.7  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 285 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.07 
 
 		 251 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 250 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.07 
 
 		 251 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.07 
 
 		 251 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 275 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 196 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1020  Methyltransferase type 11  37.01 
 
 		 273 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.833494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  33.06 
 
 		 259 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 285 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 337 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 263 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  26.17 
 
 		 211 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5884  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.06 
 
 		 422 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0711978  normal  0.210944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.74 
 
 		 258 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 239 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.71 
 
 		 251 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  35.54 
 
 		 262 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 286 aa  47.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 250 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 250 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 250 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 245 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  29.77 
 
 		 261 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  36.13 
 
 		 273 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  30.58 
 
 		 256 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  30.58 
 
 		 256 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.17 
 
 		 259 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 275 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1422  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.03 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.58 
 
 		 256 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.88 
 
 		 250 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  25 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0628  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.13 
 
 		 230 aa  46.2  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308347  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  30.58 
 
 		 256 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  28.47 
 
 		 541 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 203 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  30.58 
 
 		 256 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  30.58 
 
 		 256 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6936  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.97 
 
 		 343 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389274  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 262 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3266  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.09 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  35.23 
 
 		 264 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  38.14 
 
 		 276 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2597  methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 236 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 273 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.37 
 
 		 256 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  35 
 
 		 287 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7789  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 276 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  31.16 
 
 		 263 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  28.47 
 
 		 541 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  39.66 
 
 		 269 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>