186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1987 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2352  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  683    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1987  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 335 aa  683    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.791499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.82 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  27.49 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  27.34 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  26.77 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.09 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  21.92 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  25.44 
 
 		 357 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.79 
 
 		 258 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.29 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  31.79 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  29.45 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  22.82 
 
 		 252 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  25.35 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  23.91 
 
 		 356 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.48 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.08 
 
 		 262 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 274 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  31.73 
 
 		 380 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  26.61 
 
 		 351 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  33.66 
 
 		 242 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  25.09 
 
 		 348 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  23.66 
 
 		 357 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0517  methyltransferase type 12  33.98 
 
 		 338 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  25.52 
 
 		 348 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  25.84 
 
 		 351 aa  49.7  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3155  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 144 aa  49.7  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.290736  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.19 
 
 		 381 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  25 
 
 		 377 aa  49.3  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0394  methyltransferase type 12  28.07 
 
 		 347 aa  49.3  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  23.91 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  28.99 
 
 		 212 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  26.04 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  26.98 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  25.48 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.71 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  30 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1318  O-methyltransferase family protein  32.3 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  29.63 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  30.09 
 
 		 258 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  30.77 
 
 		 283 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.82 
 
 		 223 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  27.72 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 277 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  27.62 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2169  methyltransferase type 11  27.48 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  27.22 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1024  Methyltransferase type 12  30.3 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31784 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  32.26 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  29.63 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  25.83 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  27.33 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2134  hypothetical protein  29.46 
 
 		 253 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  28.85 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  30.77 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  30.77 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  26.57 
 
 		 353 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0976  Methyltransferase type 11  24.32 
 
 		 220 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.26 
 
 		 242 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.48 
 
 		 258 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.86 
 
 		 237 aa  47.4  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  33 
 
 		 268 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 210 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1183  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 179 aa  46.6  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275985  normal  0.0518629 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1546  generic methyltransferase  26.32 
 
 		 216 aa  46.2  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.03 
 
 		 254 aa  46.6  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  24.1 
 
 		 343 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 243 aa  46.6  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 242 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 200 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 200 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 209 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  27.83 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0541  methyltransferase type 12  31.07 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0157  putative methyltransferase  25.66 
 
 		 229 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  24.9 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.11 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  22.22 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  25.9 
 
 		 195 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2474  methyltransferase type 12  31.61 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0227  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.59 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.147467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  40.91 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  33.66 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  28.99 
 
 		 259 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  34.29 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  24.11 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  34.43 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.01 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.346965 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>