More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1550 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  39.61 
 
 
263 aa  199  6e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  37.35 
 
 
264 aa  182  7e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  34.85 
 
 
273 aa  178  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  30.48 
 
 
270 aa  156  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  30.53 
 
 
270 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  29.59 
 
 
279 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  29.1 
 
 
269 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.42 
 
 
291 aa  122  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.72 
 
 
352 aa  120  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  30.19 
 
 
302 aa  117  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  28.97 
 
 
268 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  35.03 
 
 
275 aa  93.6  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  34.34 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  37.06 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  31.44 
 
 
287 aa  82  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  31.19 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  34.94 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  29.3 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  34.76 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  39.52 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  26.64 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  27.39 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  27.24 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  26.03 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  27.27 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  40.91 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  29.29 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  27.35 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  30.48 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  29.76 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  25.78 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  28.57 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  27.23 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  26.05 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  25.11 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  31.29 
 
 
237 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  26.54 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  23.83 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  31.4 
 
 
291 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  27.98 
 
 
239 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  32.73 
 
 
279 aa  62.8  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  28.97 
 
 
279 aa  62.4  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  28.44 
 
 
239 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  28.17 
 
 
286 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  37.1 
 
 
274 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.87 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  30.12 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  37.14 
 
 
241 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.12 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  30 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  31.03 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.48 
 
 
209 aa  60.1  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  31.03 
 
 
273 aa  59.7  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  27.27 
 
 
280 aa  59.3  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 
274 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  27.74 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  26.49 
 
 
278 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8959  hypothetical protein  35.35 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  26.49 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  26.49 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  33.68 
 
 
280 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  34.34 
 
 
210 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  38.6 
 
 
253 aa  55.8  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  33.7 
 
 
254 aa  56.2  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.55 
 
 
296 aa  55.8  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  44.44 
 
 
250 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  26.87 
 
 
277 aa  55.5  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  50 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  35.63 
 
 
232 aa  55.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  30.71 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2519  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  39.06 
 
 
438 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163711  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  23.08 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  23.96 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 
250 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  29.63 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  32.61 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
203 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  33 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  46.67 
 
 
261 aa  53.9  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  40.74 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  40.74 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  40.74 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 
255 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
274 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  44.44 
 
 
250 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  42.59 
 
 
250 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  48.98 
 
 
255 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  33.75 
 
 
188 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2399  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 
210 aa  52.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.521103  normal  0.920683 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 
199 aa  52.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.82 
 
 
210 aa  52.4  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  42.59 
 
 
250 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.57 
 
 
255 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>