93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2192 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2192  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 166 aa  318  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3155  methyltransferase type 12  61.59 
 
 		 144 aa  168  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.290736  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3348  methyltransferase type 12  61.59 
 
 		 144 aa  167  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5724  methyltransferase type 11  61.87 
 
 		 143 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1464  Methyltransferase type 12  61.76 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.314215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4711  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3168  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1980  Methyltransferase type 12  33.57 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.546163  normal  0.238545 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.71 
 
 		 259 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.57 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 258 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2597  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 236 aa  48.5  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.65 
 
 		 260 aa  48.5  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.54 
 
 		 256 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1833  methyltransferase type 11  32.72 
 
 		 264 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  26.02 
 
 		 207 aa  47.8  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 255 aa  47.8  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 262 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 		 273 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.89 
 
 		 207 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 272 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 268 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  29.31 
 
 		 541 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2097  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 261 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 285 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  31.2 
 
 		 258 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.29 
 
 		 285 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.29 
 
 		 223 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1315  Methyltransferase type 12  32.8 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 231 aa  44.7  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 258 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  31.97 
 
 		 294 aa  44.3  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.13 
 
 		 254 aa  44.3  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 266 aa  44.3  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 264 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 287 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0994  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.56 
 
 		 341 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  27.03 
 
 		 541 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3099  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.2 
 
 		 365 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  34.94 
 
 		 265 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  48.89 
 
 		 247 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3055  methyltransferase type 11  38.16 
 
 		 285 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346509  normal  0.0118845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  30 
 
 		 288 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 275 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  27.03 
 
 		 541 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  25 
 
 		 541 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  49.15 
 
 		 264 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 269 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.75 
 
 		 258 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 290 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5739  methyltransferase type 11  40.68 
 
 		 208 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  25 
 
 		 541 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  23.28 
 
 		 293 aa  42  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  28.35 
 
 		 263 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  36.21 
 
 		 263 aa  42  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  28.77 
 
 		 348 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.62 
 
 		 264 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  29.87 
 
 		 279 aa  42  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2668  hypothetical protein  26.62 
 
 		 275 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  30.77 
 
 		 310 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  29.17 
 
 		 275 aa  42  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 277 aa  41.6  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 390 aa  41.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  31.51 
 
 		 267 aa  41.6  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  27.73 
 
 		 200 aa  41.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  28.91 
 
 		 246 aa  41.6  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1840  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.13 
 
 		 345 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.25 
 
 		 261 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.62 
 
 		 254 aa  41.6  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  30.77 
 
 		 311 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  27.05 
 
 		 287 aa  41.6  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  34.68 
 
 		 246 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.8 
 
 		 257 aa  41.2  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  30.25 
 
 		 311 aa  41.2  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 220 aa  41.2  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  47.37 
 
 		 252 aa  41.6  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.84 
 
 		 262 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  25.9 
 
 		 343 aa  41.2  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3804  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.05 
 
 		 456 aa  41.2  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.119292  normal  0.179835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3281  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 285 aa  41.2  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  normal  0.615609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 203 aa  41.2  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  26.67 
 
 		 524 aa  40.8  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  35.19 
 
 		 273 aa  40.8  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 267 aa  40.8  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  27.78 
 
 		 250 aa  40.8  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.67 
 
 		 205 aa  40.8  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.03 
 
 		 262 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  29.06 
 
 		 311 aa  40.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0299  methionine biosynthesis protein MetW  32.22 
 
 		 247 aa  40.4  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>