More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1075 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  512  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  52.19 
 
 
264 aa  258  9e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  41.37 
 
 
250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  39.11 
 
 
249 aa  202  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  36.61 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  33.47 
 
 
254 aa  164  9e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  36.67 
 
 
390 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  33.74 
 
 
250 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
390 aa  158  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  35.95 
 
 
390 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  29.96 
 
 
253 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
398 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  30.68 
 
 
247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  31.28 
 
 
253 aa  144  9e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
391 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  31.43 
 
 
464 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  31.4 
 
 
256 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
392 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
391 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4877  methyltransferase type 11  27.69 
 
 
327 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0966  putative transcriptional regulator  30 
 
 
392 aa  118  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2073  methyltransferase type 12  30.71 
 
 
239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.72 
 
 
239 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1382  methyltransferase type 12  30.42 
 
 
239 aa  99  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00680014  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0767  hypothetical protein  50 
 
 
128 aa  84  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0255585  normal  0.0371895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1961  methyltransferase type 12  29.47 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00015321  normal  0.48171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.8 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.57 
 
 
253 aa  63.2  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  30 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  30 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
208 aa  60.1  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
239 aa  59.3  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.12 
 
 
253 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  26.23 
 
 
274 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0601  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  28.02 
 
 
229 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  33.05 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.63 
 
 
232 aa  55.8  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  40.79 
 
 
268 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  30 
 
 
314 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1197  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.47 
 
 
277 aa  53.9  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  25.9 
 
 
287 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  26.39 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.52 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 
286 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
247 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  24.55 
 
 
248 aa  52.4  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  33.02 
 
 
236 aa  52  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  22.49 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  25 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  26.98 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.9 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  28.57 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1044  Methyltransferase type 11  27.12 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.87 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.27 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  28.23 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.62 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0574  Methyltransferase type 11  24.14 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.77 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  26.53 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.56 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  24.18 
 
 
261 aa  50.1  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  29.57 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  30.11 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
440 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  26.77 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1612  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 
233 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
201 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.64 
 
 
251 aa  49.3  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  26.5 
 
 
209 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
187 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
254 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 
284 aa  49.3  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.71 
 
 
256 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.52 
 
 
236 aa  49.3  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.77 
 
 
250 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.83 
 
 
255 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  32.79 
 
 
280 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  25.45 
 
 
271 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.63 
 
 
373 aa  48.9  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.82 
 
 
251 aa  48.9  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.67 
 
 
256 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.67 
 
 
256 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.67 
 
 
259 aa  48.9  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  30.56 
 
 
351 aa  48.9  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.07 
 
 
296 aa  48.9  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 
252 aa  48.5  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
295 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
348 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.81 
 
 
266 aa  48.5  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.19 
 
 
272 aa  48.9  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>