65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1382 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1382  methyltransferase type 12  100 
 
 		 239 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00680014  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  94.98 
 
 		 239 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2073  methyltransferase type 12  78.24 
 
 		 239 aa  370  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1961  methyltransferase type 12  44.92 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00015321  normal  0.48171 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  37.65 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  35.89 
 
 		 247 aa  121  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  34.39 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  33.76 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  32.51 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4877  methyltransferase type 11  37.19 
 
 		 327 aa  118  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  31.28 
 
 		 256 aa  118  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  32.78 
 
 		 390 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  35.12 
 
 		 464 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 390 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  26.75 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 390 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  30.42 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 391 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 398 aa  93.2  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 391 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 392 aa  87  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0966  putative transcriptional regulator  25.21 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  25 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0767  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  52.4  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0255585  normal  0.0371895 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  24.4 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  35.42 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2932  methyltransferase type 12  31.31 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.519548 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  34.01 
 
 		 269 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  37.78 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  26.82 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  31.36 
 
 		 332 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  29.66 
 
 		 315 aa  45.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  29.66 
 
 		 399 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.79 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1258  hypothetical protein  36.61 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  30.38 
 
 		 328 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  41.59 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1827  hypothetical protein  22.14 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580816  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.01 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  36.63 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  21.39 
 
 		 351 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.84 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  40.17 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  22.68 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  28.82 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  34.29 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  22.68 
 
 		 284 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  32.35 
 
 		 449 aa  43.5  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2455  biotin biosynthesis protein BioC  33.93 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1283  dimethyladenosine transferase  35.71 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  32.53 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  32.08 
 
 		 314 aa  42.4  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4229  hypothetical protein  29 
 
 		 652 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.60873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  37.5 
 
 		 351 aa  42.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  22.99 
 
 		 351 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 256 aa  42  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  28.87 
 
 		 438 aa  42  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>