35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0767 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0767  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  266  8.999999999999999e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0255585  normal  0.0371895 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  50 
 
 		 250 aa  84  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  46.88 
 
 		 250 aa  83.6  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  47.92 
 
 		 249 aa  80.1  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  46.94 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  42.27 
 
 		 250 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  40.21 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  41.75 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 390 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  38.38 
 
 		 464 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2073  methyltransferase type 12  38.38 
 
 		 239 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.67 
 
 		 239 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1382  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 239 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00680014  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  37.78 
 
 		 256 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4877  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 327 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 398 aa  50.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0966  putative transcriptional regulator  33.91 
 
 		 392 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 391 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 247 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 288 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0601  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 236 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.06 
 
 		 255 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  37.68 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  41.1 
 
 		 314 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 275 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 277 aa  41.2  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 278 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>