More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0601 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0601  Methyltransferase type 11  100 
 
 
236 aa  488  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3579  methyltransferase  41.88 
 
 
235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0715591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2326  methyltransferase  43.58 
 
 
219 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.139311  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1942  Methyltransferase type 11  37.33 
 
 
241 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000627742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4825  Methyltransferase type 11  38.17 
 
 
260 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2603  Methyltransferase type 11  35.12 
 
 
239 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1317  hypothetical protein  35.44 
 
 
238 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26000  methyltransferase family protein  39.81 
 
 
238 aa  152  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.709273  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3152  methyltransferase type 11  34.33 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.953412  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  42.69 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  33.06 
 
 
559 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  34.45 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  35.83 
 
 
382 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
286 aa  65.1  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 
271 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 
264 aa  62  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  36.75 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
254 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  28.57 
 
 
311 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
328 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 
254 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  36.79 
 
 
304 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  32.82 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  31.97 
 
 
318 aa  60.1  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
286 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  35.85 
 
 
310 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  29.41 
 
 
311 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3068  Methyltransferase type 12  41.24 
 
 
288 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  28.16 
 
 
279 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  33.94 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  32.74 
 
 
369 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
277 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
249 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003861  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.13 
 
 
418 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01818  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.81 
 
 
418 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  32.69 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  35 
 
 
354 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  35 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1175  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.32 
 
 
406 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.626546  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  37.17 
 
 
213 aa  57  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
572 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  30.16 
 
 
261 aa  56.6  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 
283 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.74 
 
 
252 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
328 aa  56.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.65 
 
 
310 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  26.19 
 
 
232 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  35.85 
 
 
310 aa  55.5  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  31.65 
 
 
310 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  40.95 
 
 
247 aa  55.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
284 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  32.8 
 
 
250 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  26.55 
 
 
311 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  35.51 
 
 
464 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  35.46 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 
276 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1996  generic methyltransferase  30.15 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.17 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.41 
 
 
265 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  37.27 
 
 
285 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.85 
 
 
248 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
187 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  38.53 
 
 
207 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  23.78 
 
 
248 aa  53.1  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  28.26 
 
 
253 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  32.79 
 
 
261 aa  53.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  28.26 
 
 
253 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  37.17 
 
 
236 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  44.55 
 
 
269 aa  52.4  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  27.97 
 
 
278 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  34.96 
 
 
289 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  26.77 
 
 
246 aa  52  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.08 
 
 
330 aa  52  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
266 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  32.45 
 
 
353 aa  52  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.9 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1076  hypothetical protein  30.61 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0783681  normal  0.62878 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.51 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  32.48 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0640  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.99 
 
 
432 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00257211  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  34.51 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  27.17 
 
 
275 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.19 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
278 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1487  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.67 
 
 
406 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2594  Methyltransferase type 11  36.15 
 
 
262 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  41.1 
 
 
288 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.45 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.77 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  26.47 
 
 
293 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>