More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3152 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3152  methyltransferase type 11  100 
 
 
252 aa  525  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.953412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4825  Methyltransferase type 11  42.63 
 
 
260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3579  methyltransferase  42.02 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0715591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2326  methyltransferase  43.24 
 
 
219 aa  183  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.139311  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1942  Methyltransferase type 11  36 
 
 
241 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000627742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
248 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2603  Methyltransferase type 11  36.87 
 
 
239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1317  hypothetical protein  36.27 
 
 
238 aa  142  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26000  methyltransferase family protein  36.27 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.709273  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0601  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  26.83 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
271 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  26.21 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.81 
 
 
283 aa  62  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  24.04 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  24.88 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  31.41 
 
 
273 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  23.33 
 
 
241 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  28.1 
 
 
304 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  25.7 
 
 
243 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  30.56 
 
 
310 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
284 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  32.41 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  28.23 
 
 
243 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  28.23 
 
 
243 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  28.23 
 
 
243 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  31.62 
 
 
559 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  25.37 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.75 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  28 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  25.33 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  33.02 
 
 
213 aa  57  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  29.63 
 
 
311 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  21.53 
 
 
218 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  27.34 
 
 
278 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
287 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  29.01 
 
 
271 aa  56.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
289 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  28.15 
 
 
282 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  28.57 
 
 
309 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  28 
 
 
222 aa  55.5  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  28.7 
 
 
310 aa  55.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  24.27 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  29.13 
 
 
342 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.18 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  28.7 
 
 
311 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.96 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  36 
 
 
312 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 
301 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  26.85 
 
 
304 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0512  hypothetical protein  25.27 
 
 
207 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  28.68 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  29.81 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.61 
 
 
258 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.11 
 
 
256 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  28.7 
 
 
310 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.71 
 
 
230 aa  52.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  26.29 
 
 
274 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.11 
 
 
256 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.79 
 
 
235 aa  52.4  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  28.46 
 
 
287 aa  52.4  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  26.05 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  27.65 
 
 
279 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 
711 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  31.93 
 
 
343 aa  52  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  27.7 
 
 
306 aa  52.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  29.31 
 
 
255 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  28.78 
 
 
351 aa  52  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 
232 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  25.29 
 
 
301 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  29.63 
 
 
310 aa  52  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  27.48 
 
 
274 aa  52  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  29.22 
 
 
256 aa  52  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1153  SAM-dependent methyltransferase  24.19 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  25.53 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  26.18 
 
 
328 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  28.95 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
276 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
225 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0807  methyltransferase type 11  24.24 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  23.6 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  31.25 
 
 
394 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  30.58 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  30.65 
 
 
282 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  28.33 
 
 
392 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  27.41 
 
 
387 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  24.06 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  27.41 
 
 
387 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  27.41 
 
 
387 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  23.27 
 
 
238 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.62 
 
 
230 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.13 
 
 
330 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  25.4 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
710 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>