173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2603 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2603  Methyltransferase type 11  100 
 
 
239 aa  494  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1942  Methyltransferase type 11  47.51 
 
 
241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000627742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3579  methyltransferase  41.99 
 
 
235 aa  209  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0715591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2326  methyltransferase  42.73 
 
 
219 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.139311  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4825  Methyltransferase type 11  38.11 
 
 
260 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1317  hypothetical protein  36.75 
 
 
238 aa  161  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26000  methyltransferase family protein  36.71 
 
 
238 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.709273  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3152  methyltransferase type 11  36.87 
 
 
252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.953412  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0601  Methyltransferase type 11  35.12 
 
 
236 aa  142  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967057  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  29.65 
 
 
248 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  25.15 
 
 
295 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
572 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  26.89 
 
 
246 aa  52.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  31 
 
 
387 aa  52.4  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  31 
 
 
387 aa  52.4  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  31.09 
 
 
280 aa  52.4  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  31 
 
 
387 aa  52.4  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  27.34 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  26.57 
 
 
295 aa  52  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.83 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  29.91 
 
 
304 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  27.22 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.62 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  26.18 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
271 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  28.68 
 
 
237 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
284 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  30.83 
 
 
271 aa  48.9  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  29.46 
 
 
310 aa  48.9  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.03 
 
 
268 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2834  methyltransferase type 12  29.63 
 
 
254 aa  48.9  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  28.66 
 
 
312 aa  48.9  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  29.22 
 
 
261 aa  48.5  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0994  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.33 
 
 
341 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0972  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.1 
 
 
322 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545338  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  24.39 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5113  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.04 
 
 
298 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  32.11 
 
 
310 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  27.78 
 
 
280 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  26.17 
 
 
328 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  27.03 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.3 
 
 
423 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  29.52 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  24.66 
 
 
246 aa  47  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0725  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.69 
 
 
427 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0644252  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  27.5 
 
 
243 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 
634 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
417 aa  46.6  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1239  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.1 
 
 
298 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.173054 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 
254 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  28.69 
 
 
237 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4606  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.95 
 
 
442 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  hitchhiker  0.0000312822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.03 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0440194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0951  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.81 
 
 
322 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.615497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0969  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.81 
 
 
322 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0437225 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  24.87 
 
 
286 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  25.53 
 
 
293 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.5 
 
 
255 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  29.52 
 
 
293 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
289 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  26.23 
 
 
238 aa  45.8  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  34.04 
 
 
390 aa  45.4  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.64 
 
 
253 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  30 
 
 
269 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.88 
 
 
330 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.74 
 
 
201 aa  45.4  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0952  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.7 
 
 
289 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.735762  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  24.03 
 
 
239 aa  45.4  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  24.64 
 
 
261 aa  45.4  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0970  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.7 
 
 
289 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0396858 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  26.5 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.57 
 
 
280 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0069  phosphoethanolamine N-methyltransferase  28.57 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0516193  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  28.04 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  20.99 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  25 
 
 
382 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  30.47 
 
 
278 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0069  demethylmenaquinone methyltransferase  26.24 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2359  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.45 
 
 
412 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  30.47 
 
 
278 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.82 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  28.04 
 
 
311 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1568  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.57 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0973  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.7 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1480  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.57 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.731828  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  23.77 
 
 
559 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.46 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  25.81 
 
 
776 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  25 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  27.93 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4948  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.68 
 
 
312 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0335846 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  21.97 
 
 
301 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>