More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1577 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  100 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3542  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  51.79 
 
 		 243 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  43.3 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  41.3 
 
 		 242 aa  125  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  41.75 
 
 		 225 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  38.25 
 
 		 248 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 233 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  38.5 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1820  Methyltransferase type 11  33.2 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 244 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1612  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 233 aa  86.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.79 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1806  hypothetical protein  33.15 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.727626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  28.99 
 
 		 776 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  30.77 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  30.77 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.37 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.59 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  36.03 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  26.7 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  34.56 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  29.74 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  34.9 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  24.39 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3273  Methyltransferase type 12  26.74 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  28.66 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4299  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  26.62 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  28.23 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  40.57 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.4 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  28.23 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.66 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.9 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2987  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 227 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  39.45 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  38.83 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.66 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  26.45 
 
 		 168 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  39.78 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.66 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1107  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000024233 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3743  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3339  methyltransferase  28.06 
 
 		 239 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 		 232 aa  57  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530089  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  39.78 
 
 		 248 aa  57  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  31.36 
 
 		 355 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 252 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 218 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 249 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  35.58 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.32 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.57 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.63 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  31.9 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.13 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  30 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.63 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0038  methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.02 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2320  Methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.92 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>