51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26000 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_26000  methyltransferase family protein  100 
 
 
238 aa  493  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.709273  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1317  hypothetical protein  59.07 
 
 
238 aa  301  8.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3579  methyltransferase  39.32 
 
 
235 aa  186  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0715591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2326  methyltransferase  39.53 
 
 
219 aa  175  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.139311  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1942  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 
241 aa  162  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000627742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2603  Methyltransferase type 11  36.71 
 
 
239 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4825  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
260 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3152  methyltransferase type 11  36.27 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.953412  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0601  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967057  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  25.56 
 
 
275 aa  52  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  29.06 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2594  Methyltransferase type 11  41.35 
 
 
262 aa  50.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  35.61 
 
 
266 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
284 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  27.23 
 
 
262 aa  46.2  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.94 
 
 
280 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  30.47 
 
 
559 aa  45.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 
254 aa  45.4  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  28.21 
 
 
280 aa  45.4  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  25.91 
 
 
411 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  25 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  31.45 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.13 
 
 
283 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.88 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  31.93 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  39.76 
 
 
276 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01774  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.03 
 
 
356 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.441761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  33.1 
 
 
280 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 
280 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.3 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  29.13 
 
 
261 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
275 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  24.16 
 
 
199 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 
248 aa  42.4  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  30.33 
 
 
304 aa  42.4  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  27.66 
 
 
236 aa  42.4  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
275 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
275 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
235 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0781  hypothetical protein  26.6 
 
 
121 aa  42  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.069115  normal  0.0215827 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
235 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
235 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 
242 aa  41.6  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 
283 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0386  methyltransferase  35.56 
 
 
225 aa  42  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>