212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1172 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  470  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1971  hypothetical protein  88.13 
 
 
219 aa  394  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0860  hypothetical protein  84.02 
 
 
219 aa  385  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.880222 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0975  hypothetical protein  64.22 
 
 
220 aa  300  2e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.753876 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0782  hypothetical protein  80 
 
 
155 aa  265  4e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.138786  normal  0.0233104 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0781  hypothetical protein  85.15 
 
 
121 aa  185  5e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.069115  normal  0.0215827 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0365  putative RNA methylase  52 
 
 
161 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  50.32 
 
 
161 aa  164  8e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  48.03 
 
 
211 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1909  hypothetical protein  46.98 
 
 
165 aa  142  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  41.4 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  45.8 
 
 
219 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  43.51 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  40.32 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  41.33 
 
 
207 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  41.56 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1609  putative RNA methylase  42.95 
 
 
206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0178031  normal  0.513301 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1705  putative RNA methylase  38.51 
 
 
155 aa  109  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92891  predicted protein  42.19 
 
 
186 aa  87.8  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.399442  normal  0.0255193 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  34.29 
 
 
174 aa  84.7  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0271  hypothetical protein  33.77 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0202  hypothetical protein  36.72 
 
 
148 aa  70.5  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.377105  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0689  hypothetical protein  42 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00351729 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0262  hypothetical protein  40.37 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  normal  0.0219963 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37393  predicted protein  31.97 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.392699  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35472  predicted protein  32.87 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176314  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1247  hypothetical protein  40 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0187  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.06 
 
 
396 aa  58.5  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00117459  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3206  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.13 
 
 
428 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1314  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.13 
 
 
428 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.393675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0989  hypothetical protein  29.37 
 
 
185 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3063  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.13 
 
 
418 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2293  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.63 
 
 
414 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000690855 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3049  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.13 
 
 
418 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32132  predicted protein  27.66 
 
 
328 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0798  cyclopropane fatty acid synthase-like protein  33.73 
 
 
374 aa  57  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000275065  hitchhiker  2.13005e-17 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2160  putative cyclopropane fatty acid synthase  33.61 
 
 
423 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2676  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.37 
 
 
485 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5901  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.85 
 
 
406 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.544208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2920  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.44 
 
 
411 aa  55.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.211142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1451  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.4 
 
 
410 aa  55.5  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2643  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.14 
 
 
413 aa  55.1  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1574  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.25 
 
 
420 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00420728  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1055  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.97 
 
 
413 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.910912  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1003  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.76 
 
 
413 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.18 
 
 
415 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2906  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.76 
 
 
409 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698202  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0716  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.18 
 
 
406 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.719598  normal  0.139789 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0513  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.81 
 
 
404 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145575  normal  0.33275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3175  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.47 
 
 
420 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.239418  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0786  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.18 
 
 
406 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0668711  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0627  hypothetical protein  30 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.717835 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1170  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.15 
 
 
418 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.513218  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1241  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.65 
 
 
418 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101333  normal  0.895253 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1171  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.15 
 
 
418 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4741  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  22.82 
 
 
423 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.46 
 
 
445 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1958  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.14 
 
 
406 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2569  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.14 
 
 
406 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2593  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.14 
 
 
406 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.604704  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2433  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.75 
 
 
419 aa  52.4  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.419003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0766  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase protein  27.18 
 
 
406 aa  52.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.159603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0716  cyclopropane fatty acid synthase family protein  29.17 
 
 
406 aa  52.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000471122  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2019  predicted protein  24.77 
 
 
877 aa  52  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0204163 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2554  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.61 
 
 
409 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0910819  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0301  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.51 
 
 
392 aa  52  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3426  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.1 
 
 
390 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3185  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.1 
 
 
390 aa  52  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3113  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.1 
 
 
390 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3222  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.18 
 
 
404 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193191  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0727  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.36 
 
 
406 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.560156  normal  0.551186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3207  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.1 
 
 
390 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7150  cyclopropane fatty-acyl-phospholipid synthase  30.36 
 
 
419 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133822  normal  0.013333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0814  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.43 
 
 
411 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1066  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.93 
 
 
424 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3460  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.1 
 
 
390 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2488  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.92 
 
 
406 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697933  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2417  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.9 
 
 
414 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0740  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.03 
 
 
404 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2617  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.92 
 
 
406 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2096  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.71 
 
 
420 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2734  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.49 
 
 
395 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389942  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  30.77 
 
 
387 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3379  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.17 
 
 
418 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  30.77 
 
 
387 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  32.05 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5666  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.71 
 
 
395 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228934  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2870  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.4 
 
 
482 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24578  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  31.53 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.5 
 
 
447 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1917  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.2 
 
 
424 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0513783  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2709  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.83 
 
 
417 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.443104  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  30.77 
 
 
387 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1748  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.78 
 
 
396 aa  50.4  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.829611  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  37.18 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3928  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.68 
 
 
409 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304627 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3438  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.48 
 
 
390 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1494  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31 
 
 
422 aa  50.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1060  cyclopropane fatty acid synthase family protein  29.89 
 
 
406 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189279  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  36.49 
 
 
394 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>