21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32132 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_32132  predicted protein  100 
 
 
328 aa  680    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1909  hypothetical protein  29.79 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  28.9 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  32.59 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  27.15 
 
 
265 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  29.32 
 
 
210 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.094641 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  25.93 
 
 
161 aa  63.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  30.37 
 
 
207 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32792  predicted protein  24.7 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  26.67 
 
 
206 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  28.36 
 
 
224 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  27.66 
 
 
236 aa  57  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0860  hypothetical protein  27.27 
 
 
219 aa  55.1  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.880222 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1971  hypothetical protein  27.66 
 
 
219 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33223  predicted protein  28.15 
 
 
229 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0013315  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0975  hypothetical protein  23.7 
 
 
220 aa  50.4  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.753876 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1609  putative RNA methylase  25.83 
 
 
206 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0178031  normal  0.513301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  24.5 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43583  predicted protein  25.74 
 
 
224 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 
300 aa  42.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  22.07 
 
 
312 aa  42.4  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>