More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1909 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1909  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  335  9.999999999999999e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.566778 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  69.62 
 
 		 161 aa  238  4e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  50.94 
 
 		 210 aa  158  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  49.37 
 
 		 224 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  44.79 
 
 		 219 aa  150  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  46.71 
 
 		 206 aa  147  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  46.36 
 
 		 265 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  45.57 
 
 		 207 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  46.98 
 
 		 236 aa  142  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  46.41 
 
 		 211 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0365  putative RNA methylase  45.16 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0975  hypothetical protein  45.03 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.753876 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0860  hypothetical protein  45.03 
 
 		 219 aa  140  8e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.880222 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1971  hypothetical protein  44.37 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1609  putative RNA methylase  45.86 
 
 		 206 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0178031  normal  0.513301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0271  hypothetical protein  39.86 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1705  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 155 aa  88.6  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92891  predicted protein  35.12 
 
 		 186 aa  87.8  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.399442  normal  0.0255193 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0782  hypothetical protein  43.9 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.138786  normal  0.0233104 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0306  hypothetical protein  41.32 
 
 		 253 aa  77.4  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.407855 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32132  predicted protein  29.79 
 
 		 328 aa  73.9  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0781  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.069115  normal  0.0215827 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37585  predicted protein  26.59 
 
 		 205 aa  72  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  31.29 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0262  hypothetical protein  33.87 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  normal  0.0219963 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32792  predicted protein  28.06 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0202  hypothetical protein  34.95 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.377105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0689  hypothetical protein  32.67 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00351729 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.84 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33223  predicted protein  29.27 
 
 		 229 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0013315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 271 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  34.31 
 
 		 387 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  34.31 
 
 		 387 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  24.82 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  34.31 
 
 		 387 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1247  hypothetical protein  32.31 
 
 		 280 aa  52.4  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1356  hypothetical protein  32.47 
 
 		 187 aa  51.2  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.48 
 
 		 305 aa  50.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.29 
 
 		 308 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.08 
 
 		 293 aa  50.8  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.21 
 
 		 237 aa  50.8  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  43.4 
 
 		 311 aa  50.8  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.48 
 
 		 295 aa  50.8  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.56 
 
 		 295 aa  50.8  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2906  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.47 
 
 		 409 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.71 
 
 		 292 aa  50.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.58 
 
 		 293 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1451  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.04 
 
 		 410 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3928  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.26 
 
 		 409 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304627 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.31 
 
 		 295 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.17 
 
 		 304 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  32.94 
 
 		 273 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  29.58 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  45 
 
 		 296 aa  49.7  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_6437  predicted protein  32.28 
 
 		 297 aa  49.7  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000205122  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.38 
 
 		 306 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.38 
 
 		 295 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.38 
 
 		 293 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1574  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29 
 
 		 420 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00420728  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0054  methyltransferase type 12  26.17 
 
 		 247 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.38 
 
 		 293 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.38 
 
 		 295 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.38 
 
 		 293 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  30.61 
 
 		 287 aa  48.9  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0301  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.11 
 
 		 392 aa  48.5  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  30.33 
 
 		 258 aa  48.5  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3207  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.84 
 
 		 390 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2375  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.44 
 
 		 494 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.31 
 
 		 295 aa  48.5  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3460  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.84 
 
 		 390 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2565  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.49 
 
 		 409 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606524  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5884  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.72 
 
 		 422 aa  48.5  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0711978  normal  0.210944 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.16 
 
 		 294 aa  48.5  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37393  predicted protein  26.03 
 
 		 228 aa  48.5  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.392699  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35472  predicted protein  26.21 
 
 		 228 aa  48.5  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176314  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0766  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase protein  30.99 
 
 		 406 aa  48.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.159603 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.23 
 
 		 293 aa  48.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  30 
 
 		 261 aa  48.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0814  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.87 
 
 		 411 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  25.62 
 
 		 280 aa  47.4  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0891  methyltransferase  43.55 
 
 		 213 aa  47.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.29 
 
 		 293 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3185  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.49 
 
 		 390 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3113  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.49 
 
 		 390 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638061  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  31.94 
 
 		 360 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42880  predicted protein  24.09 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.401564  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3189  MCP methyltransferase, CheR-type  26.55 
 
 		 297 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00181305  normal  0.0716024 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.67 
 
 		 477 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  32.53 
 
 		 274 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.78 
 
 		 415 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.03 
 
 		 300 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2838  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.49 
 
 		 409 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3426  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.49 
 
 		 390 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1620  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.18 
 
 		 419 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.690918 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2010  methyltransferase small  30.77 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0221  hypothetical protein  35.06 
 
 		 329 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0373645  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.95 
 
 		 429 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107319  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1380  hypothetical protein  35.06 
 
 		 329 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.160264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1791  hypothetical protein  35.06 
 
 		 329 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0523505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.06 
 
 		 304 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>