178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1622 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  100 
 
 		 161 aa  327  3e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1909  hypothetical protein  69.62 
 
 		 165 aa  238  4e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  50.32 
 
 		 236 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0860  hypothetical protein  50.99 
 
 		 219 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.880222 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0365  putative RNA methylase  49.67 
 
 		 161 aa  160  6e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0975  hypothetical protein  50.33 
 
 		 220 aa  160  8.000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.753876 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1971  hypothetical protein  49.67 
 
 		 219 aa  158  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  50.33 
 
 		 211 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  50 
 
 		 210 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  47.4 
 
 		 219 aa  152  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  49.01 
 
 		 265 aa  147  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  45.03 
 
 		 224 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  44.44 
 
 		 207 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  45.1 
 
 		 206 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1609  putative RNA methylase  48.91 
 
 		 206 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0178031  normal  0.513301 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1705  putative RNA methylase  36.67 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0271  hypothetical protein  39.07 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0782  hypothetical protein  43.82 
 
 		 155 aa  90.5  8e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.138786  normal  0.0233104 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92891  predicted protein  34.52 
 
 		 186 aa  84.3  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.399442  normal  0.0255193 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0306  hypothetical protein  40.5 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.407855 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0781  hypothetical protein  43.9 
 
 		 121 aa  77  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.069115  normal  0.0215827 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37585  predicted protein  25.14 
 
 		 205 aa  67  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0689  hypothetical protein  37.62 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00351729 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32132  predicted protein  25.32 
 
 		 328 aa  63.9  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0202  hypothetical protein  35.92 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.377105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0262  hypothetical protein  33.06 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  normal  0.0219963 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32792  predicted protein  24.64 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1247  hypothetical protein  32.56 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35472  predicted protein  29.73 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176314  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37393  predicted protein  29.53 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.392699  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1135  hypothetical protein  42.03 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117463  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0054  methyltransferase type 12  26.85 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0989  hypothetical protein  22.67 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33223  predicted protein  28.05 
 
 		 229 aa  52.4  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0013315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  27.27 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  30.88 
 
 		 360 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3025  hypothetical protein  26.72 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1941  hypothetical protein  23.72 
 
 		 212 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86805  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.29 
 
 		 293 aa  48.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5118  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.99 
 
 		 465 aa  48.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1841  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.53 
 
 		 465 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6262  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.53 
 
 		 465 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1817  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.53 
 
 		 465 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17151  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43583  predicted protein  39.44 
 
 		 224 aa  47.4  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2883  hypothetical protein  25.19 
 
 		 238 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.81 
 
 		 296 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  30.49 
 
 		 478 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  30.26 
 
 		 480 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  32.93 
 
 		 554 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.29 
 
 		 300 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  25.93 
 
 		 349 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1717  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  26.19 
 
 		 403 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.05 
 
 		 295 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1839  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.03 
 
 		 472 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0012393  normal  0.235598 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  27.27 
 
 		 477 aa  45.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1728  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.53 
 
 		 484 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171324  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1755  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.53 
 
 		 484 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.65 
 
 		 295 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  24.78 
 
 		 258 aa  44.7  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  26.42 
 
 		 350 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.38 
 
 		 295 aa  44.3  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1356  hypothetical protein  32.86 
 
 		 187 aa  44.3  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.38 
 
 		 295 aa  44.3  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16911  predicted protein  45.45 
 
 		 378 aa  44.3  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2181  hypothetical protein  21.31 
 
 		 197 aa  43.9  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.498275  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0328  hypothetical protein  32.43 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0787976  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  28.93 
 
 		 482 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0312  methyltransferase  32.43 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1037  Methyltransferase type 12  25.81 
 
 		 253 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1350  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.89 
 
 		 465 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0719078  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.89 
 
 		 487 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2360  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.89 
 
 		 465 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.410673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0343  hypothetical protein  32.43 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  29.23 
 
 		 246 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00196  biotin synthesis protein  25.15 
 
 		 232 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.505545  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0967  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.4 
 
 		 446 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  normal  0.0206245 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.22 
 
 		 296 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5532  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.5 
 
 		 440 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1700  modification methylase NspV  34.92 
 
 		 484 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0057  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.89 
 
 		 465 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0375  hypothetical protein  32.43 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2233  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.89 
 
 		 465 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206864  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1112  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.89 
 
 		 465 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191948  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.42 
 
 		 300 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0437  hypothetical protein  32.43 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1397  hypothetical protein  43.33 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  31.71 
 
 		 476 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2229  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.89 
 
 		 498 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.42 
 
 		 300 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.47 
 
 		 300 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.11 
 
 		 306 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0790  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.41 
 
 		 398 aa  43.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000257674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.47 
 
 		 300 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  30.49 
 
 		 488 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.47 
 
 		 300 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1451  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.09 
 
 		 410 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0777  hypothetical protein  34.85 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.65 
 
 		 295 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.74 
 
 		 415 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>