38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0054 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0054  methyltransferase type 12  100 
 
 		 247 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0032  methyltransferase type 12  64.17 
 
 		 265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0051  methyltransferase type 12  63.22 
 
 		 265 aa  248  6e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.139499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0053  methyltransferase type 12  58.3 
 
 		 273 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0202  methyltransferase type 12  57.38 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0065  methyltransferase type 12  63.98 
 
 		 271 aa  221  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2871  flagellar motor protein  63.68 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1002  methyltransferase type 12  57.49 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3353  Methyltransferase type 12  34.23 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1037  Methyltransferase type 12  34.42 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1941  hypothetical protein  27.72 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0627  hypothetical protein  32.31 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.717835 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0689  hypothetical protein  36.89 
 
 		 174 aa  62  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00351729 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0266  hypothetical protein  30.58 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0202  hypothetical protein  36.89 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.377105  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  26.85 
 
 		 161 aa  55.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1498  hypothetical protein  28.8 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.19 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1569  methyltransferase type 11  32 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1242  hypothetical protein  26.19 
 
 		 251 aa  48.9  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  22.54 
 
 		 174 aa  47.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1909  hypothetical protein  26.17 
 
 		 165 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0262  hypothetical protein  37.25 
 
 		 163 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  normal  0.0219963 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1247  hypothetical protein  33.06 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0365  putative RNA methylase  24.68 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0699  putative methyltransferase  32.58 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.25876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.5 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 348 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  26.75 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  22.95 
 
 		 206 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.03 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  31.78 
 
 		 351 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  31.78 
 
 		 351 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  27.45 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  24.79 
 
 		 213 aa  42.4  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  30.83 
 
 		 351 aa  42  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.03 
 
 		 258 aa  42.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  45.61 
 
 		 367 aa  42  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>