54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1037 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1037  Methyltransferase type 12  100 
 
 
253 aa  503  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3353  Methyltransferase type 12  40.91 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1498  hypothetical protein  32.13 
 
 
262 aa  122  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0627  hypothetical protein  37.89 
 
 
247 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.717835 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1941  hypothetical protein  35.6 
 
 
212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86805  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0266  hypothetical protein  34.96 
 
 
249 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1242  hypothetical protein  31.31 
 
 
251 aa  99  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0032  methyltransferase type 12  33.5 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0051  methyltransferase type 12  34.01 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.139499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0053  methyltransferase type 12  32.77 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1002  methyltransferase type 12  38.26 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0065  methyltransferase type 12  33.94 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0202  methyltransferase type 12  36.27 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0054  methyltransferase type 12  35.61 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0689  hypothetical protein  34.75 
 
 
174 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00351729 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2871  flagellar motor protein  32.87 
 
 
297 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1247  hypothetical protein  27.03 
 
 
280 aa  62.4  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0202  hypothetical protein  36.54 
 
 
148 aa  59.7  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.377105  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  29.84 
 
 
186 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  29.91 
 
 
174 aa  54.7  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0262  hypothetical protein  26.21 
 
 
163 aa  49.3  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  normal  0.0219963 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
340 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  28.35 
 
 
355 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0989  hypothetical protein  27.2 
 
 
185 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  35.21 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  35.21 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  35.21 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
344 aa  46.6  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0087  glycosyl transferase  33.33 
 
 
712 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533314  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  34.02 
 
 
206 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  25.96 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1501  hypothetical protein  26.28 
 
 
191 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000010842  normal  0.0102039 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  28.39 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.490021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  40 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30 
 
 
202 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  36.96 
 
 
223 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  31.17 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  29.01 
 
 
335 aa  43.5  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37585  predicted protein  33.33 
 
 
205 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  31.17 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  27.08 
 
 
284 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  25.4 
 
 
161 aa  43.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 
227 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  26.96 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  27.03 
 
 
205 aa  42.7  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  38 
 
 
457 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0865  Methyltransferase type 12  31.82 
 
 
232 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 
200 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 
200 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  26.73 
 
 
275 aa  42  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1191  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  30.49 
 
 
211 aa  42  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 
270 aa  42  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3031  FHA domain-containing protein  37.5 
 
 
278 aa  42  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>