27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0053 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0053  methyltransferase type 12  100 
 
 		 273 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0032  methyltransferase type 12  62.75 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0051  methyltransferase type 12  61.83 
 
 		 265 aa  258  9e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.139499  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0054  methyltransferase type 12  57.61 
 
 		 247 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0202  methyltransferase type 12  53.33 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0065  methyltransferase type 12  63.64 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1002  methyltransferase type 12  52.48 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2871  flagellar motor protein  53.91 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1498  hypothetical protein  30.23 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3353  Methyltransferase type 12  34.65 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1037  Methyltransferase type 12  33.47 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0627  hypothetical protein  33.08 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.717835 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1242  hypothetical protein  29.48 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1941  hypothetical protein  25.58 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0202  hypothetical protein  40.19 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.377105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1501  hypothetical protein  32.21 
 
 		 191 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000010842  normal  0.0102039 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0266  hypothetical protein  31.75 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0689  hypothetical protein  40.21 
 
 		 174 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00351729 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0989  hypothetical protein  26.21 
 
 		 185 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1356  hypothetical protein  28.09 
 
 		 187 aa  50.4  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1569  methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1247  hypothetical protein  36.89 
 
 		 280 aa  49.3  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0262  hypothetical protein  37.74 
 
 		 163 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  normal  0.0219963 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1705  putative RNA methylase  28.67 
 
 		 155 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  59.38 
 
 		 313 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  59.38 
 
 		 367 aa  42.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  62.07 
 
 		 313 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>