38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0989 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0989  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2181  hypothetical protein  44.5 
 
 		 197 aa  180  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.498275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1501  hypothetical protein  33.54 
 
 		 191 aa  111  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000010842  normal  0.0102039 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1356  hypothetical protein  32.02 
 
 		 187 aa  110  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  32.43 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0266  hypothetical protein  27.34 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1242  hypothetical protein  25.15 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  29.73 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  31.34 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0627  hypothetical protein  24.14 
 
 		 247 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.717835 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  29.58 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1941  hypothetical protein  27.34 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37393  predicted protein  31.97 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.392699  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35472  predicted protein  31.15 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176314  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0860  hypothetical protein  28.17 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.880222 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  22.67 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3353  Methyltransferase type 12  24.66 
 
 		 251 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1971  hypothetical protein  28.17 
 
 		 219 aa  52.4  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  25.93 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0053  methyltransferase type 12  29.55 
 
 		 273 aa  51.2  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0975  hypothetical protein  28.21 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.753876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0051  methyltransferase type 12  21.38 
 
 		 265 aa  49.3  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.139499  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1037  Methyltransferase type 12  27.2 
 
 		 253 aa  49.3  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0032  methyltransferase type 12  21.38 
 
 		 265 aa  49.3  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1498  hypothetical protein  23.98 
 
 		 262 aa  48.1  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1609  putative RNA methylase  24.62 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0178031  normal  0.513301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  24.09 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  25.18 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2871  flagellar motor protein  20.83 
 
 		 297 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  30.97 
 
 		 494 aa  43.5  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0271  hypothetical protein  27.21 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 363 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  51.28 
 
 		 356 aa  42  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  36.59 
 
 		 223 aa  41.6  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.23 
 
 		 293 aa  41.6  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  48.72 
 
 		 356 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1002  methyltransferase type 12  21.77 
 
 		 257 aa  41.2  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.42 
 
 		 259 aa  41.2  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>