25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1242 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1242  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  490  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1941  hypothetical protein  40.48 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3353  Methyltransferase type 12  44.5 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0627  hypothetical protein  40.16 
 
 		 247 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.717835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0266  hypothetical protein  37.7 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1498  hypothetical protein  30.8 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1037  Methyltransferase type 12  30.84 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1501  hypothetical protein  36.89 
 
 		 191 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000010842  normal  0.0102039 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0989  hypothetical protein  28.69 
 
 		 185 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  35.88 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1002  methyltransferase type 12  32.56 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2181  hypothetical protein  31.53 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.498275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0051  methyltransferase type 12  31.54 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.139499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0053  methyltransferase type 12  28.67 
 
 		 273 aa  52  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1356  hypothetical protein  31.25 
 
 		 187 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0032  methyltransferase type 12  31.2 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2871  flagellar motor protein  31.78 
 
 		 297 aa  48.9  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0202  hypothetical protein  36.08 
 
 		 148 aa  46.6  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.377105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  26.32 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  25.87 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0054  methyltransferase type 12  27.59 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  33.66 
 
 		 174 aa  43.5  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0689  hypothetical protein  32.99 
 
 		 174 aa  42.4  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00351729 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4986  methyltransferase type 12  27.59 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0262  hypothetical protein  34.29 
 
 		 163 aa  42  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  normal  0.0219963 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>