31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0627 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0627  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  481  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.717835 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1242  hypothetical protein  39.92 
 
 		 251 aa  158  9e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3353  Methyltransferase type 12  40.47 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1498  hypothetical protein  34.84 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1941  hypothetical protein  42.11 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1037  Methyltransferase type 12  38.46 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0266  hypothetical protein  38.7 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1002  methyltransferase type 12  41.38 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0032  methyltransferase type 12  33.64 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0051  methyltransferase type 12  33.64 
 
 		 265 aa  72  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.139499  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0054  methyltransferase type 12  32.8 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0053  methyltransferase type 12  35.29 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0202  hypothetical protein  38.78 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.377105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0202  methyltransferase type 12  37 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1501  hypothetical protein  29.11 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000010842  normal  0.0102039 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0989  hypothetical protein  24.14 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  27.36 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  30 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0689  hypothetical protein  34.69 
 
 		 174 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00351729 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2871  flagellar motor protein  33.33 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0262  hypothetical protein  36.73 
 
 		 163 aa  52  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  normal  0.0219963 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0860  hypothetical protein  30.23 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.880222 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0065  methyltransferase type 12  31.96 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1971  hypothetical protein  29.46 
 
 		 219 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1356  hypothetical protein  28.47 
 
 		 187 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1247  hypothetical protein  34.69 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  27.03 
 
 		 174 aa  47.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  28.67 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2181  hypothetical protein  22.78 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.498275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 311 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0975  hypothetical protein  28.24 
 
 		 220 aa  42  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.753876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>