21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1498 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1498  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  531  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0266  hypothetical protein  39.71 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3353  Methyltransferase type 12  35.19 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0627  hypothetical protein  34.43 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.717835 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1037  Methyltransferase type 12  32.13 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1242  hypothetical protein  30.8 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1941  hypothetical protein  32.64 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0053  methyltransferase type 12  29.84 
 
 		 273 aa  72  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0051  methyltransferase type 12  28.97 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.139499  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1002  methyltransferase type 12  29.2 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0032  methyltransferase type 12  28.97 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0202  methyltransferase type 12  27.89 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0065  methyltransferase type 12  28.29 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2871  flagellar motor protein  27.59 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0202  hypothetical protein  31.97 
 
 		 148 aa  46.6  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.377105  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0989  hypothetical protein  24.39 
 
 		 185 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0054  methyltransferase type 12  27.37 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  24.59 
 
 		 416 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0689  hypothetical protein  34.38 
 
 		 174 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00351729 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1247  hypothetical protein  25.57 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>