38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1705 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1705  putative RNA methylase  100 
 
 
155 aa  314  3e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0365  putative RNA methylase  36.6 
 
 
161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0975  hypothetical protein  40.79 
 
 
220 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.753876 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  38.51 
 
 
236 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0860  hypothetical protein  39.86 
 
 
219 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.880222 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  36.67 
 
 
161 aa  102  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1971  hypothetical protein  35.81 
 
 
219 aa  97.4  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  35.53 
 
 
224 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  36.91 
 
 
211 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  38.24 
 
 
210 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  36.96 
 
 
219 aa  94.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  34.21 
 
 
265 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1909  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  88.6  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  33.11 
 
 
206 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  34 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1609  putative RNA methylase  34.04 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0178031  normal  0.513301 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0782  hypothetical protein  36.78 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.138786  normal  0.0233104 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0202  hypothetical protein  36.36 
 
 
148 aa  57  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.377105  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1247  hypothetical protein  33.08 
 
 
280 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0271  hypothetical protein  28.66 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0689  hypothetical protein  41.03 
 
 
174 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00351729 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0262  hypothetical protein  31.78 
 
 
163 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  normal  0.0219963 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  31.48 
 
 
174 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  26.09 
 
 
292 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0781  hypothetical protein  34.21 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.069115  normal  0.0215827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  30.66 
 
 
186 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1307  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.95 
 
 
394 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69512  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1123  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.95 
 
 
394 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0181843  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0053  methyltransferase type 12  28.67 
 
 
273 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1356  hypothetical protein  29.71 
 
 
187 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.3 
 
 
423 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  30.65 
 
 
360 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4553  methyltransferase  24.55 
 
 
261 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749759  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37585  predicted protein  22.42 
 
 
205 aa  42  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3353  Methyltransferase type 12  28.39 
 
 
251 aa  40.8  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5666  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.79 
 
 
395 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228934  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2055  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.73 
 
 
286 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0989  hypothetical protein  22.92 
 
 
185 aa  40.4  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>