30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0266 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0266  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  499  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3353  Methyltransferase type 12  47.57 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1242  hypothetical protein  37.7 
 
 
251 aa  142  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1498  hypothetical protein  39.71 
 
 
262 aa  142  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1037  Methyltransferase type 12  33.63 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0627  hypothetical protein  39.23 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.717835 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1941  hypothetical protein  37.63 
 
 
212 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86805  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0032  methyltransferase type 12  32.94 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0051  methyltransferase type 12  32.55 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.139499  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  30.19 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0989  hypothetical protein  26.42 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1002  methyltransferase type 12  35.51 
 
 
257 aa  62.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  27.64 
 
 
174 aa  61.6  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0054  methyltransferase type 12  30.58 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0053  methyltransferase type 12  31.75 
 
 
273 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1356  hypothetical protein  28.31 
 
 
187 aa  57  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0689  hypothetical protein  32 
 
 
174 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00351729 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0065  methyltransferase type 12  31.03 
 
 
271 aa  53.1  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1501  hypothetical protein  27.97 
 
 
191 aa  52.4  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000010842  normal  0.0102039 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0202  methyltransferase type 12  27.33 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0202  hypothetical protein  30.89 
 
 
148 aa  51.2  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.377105  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0262  hypothetical protein  31.13 
 
 
163 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  normal  0.0219963 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2871  flagellar motor protein  28.86 
 
 
297 aa  46.6  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.84 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  30.08 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  26.26 
 
 
344 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37393  predicted protein  29.65 
 
 
228 aa  42.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.392699  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35472  predicted protein  29.65 
 
 
228 aa  42.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176314  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  33.07 
 
 
535 aa  42.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4441  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
294 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>