166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2812 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  77.9 
 
 
535 aa  801    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  100 
 
 
535 aa  1087    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  35.45 
 
 
535 aa  298  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  34.72 
 
 
509 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  33.21 
 
 
542 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  38.29 
 
 
523 aa  228  3e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  37.7 
 
 
518 aa  223  8e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  31.46 
 
 
564 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  33.12 
 
 
514 aa  212  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  34.05 
 
 
494 aa  210  5e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1600  para protein  36.56 
 
 
486 aa  207  5e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1678  putative methyltransferase  34.29 
 
 
508 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  31.92 
 
 
521 aa  178  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  32.47 
 
 
503 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0277  SAM-dependent methyltransferase  33.58 
 
 
482 aa  163  8.000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  34.77 
 
 
419 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  44.23 
 
 
252 aa  160  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
1143 aa  141  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  30.47 
 
 
1144 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0362  methyltransferase type 12  33.2 
 
 
518 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72532  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0475  methyltransferase type 12  28.84 
 
 
499 aa  101  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  26.35 
 
 
1116 aa  87.4  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3078  methyltransferase type 12  26.15 
 
 
512 aa  87  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1222  hypothetical protein  31.07 
 
 
499 aa  87  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0351348  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0189  hypothetical protein  31.07 
 
 
499 aa  87  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0465  hypothetical protein  31.07 
 
 
499 aa  87  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1110  hypothetical protein  31.07 
 
 
499 aa  87  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1462  hypothetical protein  31.07 
 
 
499 aa  87  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2605  hypothetical protein  30.51 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0031  hypothetical protein  25.08 
 
 
510 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878298  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1375  hypothetical protein  30.51 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37000  SAM-dependent methyltransferase  28.57 
 
 
488 aa  82.8  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0432577  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1066  methyltransferase type 11  26.74 
 
 
511 aa  73.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1398  hypothetical protein  29.38 
 
 
590 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2227  hypothetical protein  24.35 
 
 
514 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.642129  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3839  methyltransferase type 11  23.3 
 
 
511 aa  63.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0810259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  33 
 
 
344 aa  62.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 
366 aa  61.6  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  30.08 
 
 
209 aa  57.4  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.74 
 
 
356 aa  57  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
267 aa  57  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3432  hypothetical protein  24.81 
 
 
507 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
363 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  30.08 
 
 
780 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  24 
 
 
395 aa  54.7  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
360 aa  54.3  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
268 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
268 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
268 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  26.67 
 
 
205 aa  53.5  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
234 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
355 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
355 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
355 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  32 
 
 
268 aa  51.2  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
317 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  34.15 
 
 
207 aa  50.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  35.71 
 
 
376 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  24.43 
 
 
580 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  23.38 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.36 
 
 
346 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  32.32 
 
 
360 aa  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.64 
 
 
213 aa  49.7  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  35.35 
 
 
360 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  27.5 
 
 
355 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  32.41 
 
 
274 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1997  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  32.79 
 
 
220 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  hitchhiker  0.00554858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3717  Methyltransferase type 12  31.9 
 
 
261 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
258 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  25.64 
 
 
369 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  33.33 
 
 
353 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  24.32 
 
 
403 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  23.17 
 
 
440 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1509  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.05 
 
 
424 aa  48.5  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  31 
 
 
356 aa  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  25 
 
 
269 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0198  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  30.66 
 
 
266 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2168  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.91 
 
 
237 aa  47.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  27.81 
 
 
418 aa  47.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 
283 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2254  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.25 
 
 
417 aa  47.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.249887  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  30 
 
 
356 aa  47  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.91 
 
 
258 aa  47  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
263 aa  47  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
263 aa  47  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
263 aa  47  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2267  16S rRNA methyltransferase GidB  29.45 
 
 
219 aa  47.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0344279 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 
661 aa  47  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1951  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 
357 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.066154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  24.17 
 
 
269 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1760  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.51 
 
 
423 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157791  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  30.23 
 
 
422 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  25.9 
 
 
653 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  25.19 
 
 
779 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  24.74 
 
 
865 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  29.46 
 
 
3207 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  28.77 
 
 
204 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  28.77 
 
 
204 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
278 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  28.77 
 
 
204 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>