29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1002 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1002  methyltransferase type 12  100 
 
 		 257 aa  494  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0032  methyltransferase type 12  62.03 
 
 		 265 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0051  methyltransferase type 12  60.76 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.139499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0202  methyltransferase type 12  51.9 
 
 		 262 aa  211  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0065  methyltransferase type 12  64.08 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0053  methyltransferase type 12  52.67 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0054  methyltransferase type 12  53.5 
 
 		 247 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2871  flagellar motor protein  57.08 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3353  Methyltransferase type 12  37.21 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0627  hypothetical protein  35.58 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.717835 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1037  Methyltransferase type 12  38.26 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0266  hypothetical protein  35.51 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1498  hypothetical protein  27.03 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1941  hypothetical protein  29.19 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1242  hypothetical protein  28.49 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0689  hypothetical protein  37.93 
 
 		 174 aa  52.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00351729 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1247  hypothetical protein  34.45 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1356  hypothetical protein  32.21 
 
 		 187 aa  52.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0202  hypothetical protein  34.19 
 
 		 148 aa  51.6  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.377105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0262  hypothetical protein  36.89 
 
 		 163 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  normal  0.0219963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1569  methyltransferase type 11  40.68 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 321 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  32.69 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  29.37 
 
 		 186 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  59.38 
 
 		 313 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1909  hypothetical protein  23.49 
 
 		 165 aa  42.4  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30 
 
 		 213 aa  42.4  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  24.09 
 
 		 161 aa  42.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  62.07 
 
 		 313 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>