46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0087 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0087  glycosyl transferase  100 
 
 		 712 aa  1478    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0387  glycosyl transferase  45.65 
 
 		 471 aa  251  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2861  hypothetical protein  47.59 
 
 		 192 aa  137  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0954  hypothetical protein  36.56 
 
 		 196 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1454  methyltransferase type 11  37.91 
 
 		 197 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.398758  normal  0.372191 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2067  glycosyl transferase  30.66 
 
 		 304 aa  118  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324313  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01170  conserved expressed protein  31.49 
 
 		 343 aa  117  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2704  hypothetical protein  32.55 
 
 		 262 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0995  hypothetical protein  31.28 
 
 		 246 aa  88.6  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117127  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03400  hypothetical protein  35 
 
 		 480 aa  80.1  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00957306  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2202  hypothetical protein  32.6 
 
 		 629 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2092  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.80059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3494  glycosyl transferase  30.1 
 
 		 206 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.758418  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2180  hypothetical protein  32.73 
 
 		 209 aa  60.1  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.810913  hitchhiker  0.000154627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4303  hypothetical protein  30.22 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1007  hypothetical protein  33.03 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6735  methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4068  hypothetical protein  31.68 
 
 		 678 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720614  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  35 
 
 		 309 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  34.82 
 
 		 403 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 194 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  38.27 
 
 		 643 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  35.8 
 
 		 275 aa  51.2  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0187  hypothetical protein  38.46 
 
 		 325 aa  49.7  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 		 596 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06534  MIPC synthasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7ZA39]  25.55 
 
 		 355 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3993  hypothetical protein  37.68 
 
 		 292 aa  48.5  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2663  hypothetical protein  32.14 
 
 		 413 aa  47.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.236265 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 263 aa  47.4  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 263 aa  47.4  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 263 aa  47.4  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 243 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3845  glycosyl transferase, group 1  41.82 
 
 		 802 aa  47.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.880485  normal  0.505849 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.02 
 
 		 258 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1037  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 253 aa  46.6  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0297  hypothetical protein  28.06 
 
 		 299 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.541993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2077  methyltransferase type 12  25.71 
 
 		 456 aa  46.2  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0756749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.71 
 
 		 764 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 330 aa  45.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  26.26 
 
 		 307 aa  45.4  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3799  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 204 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.251695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4962  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 222 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0297  hypothetical protein  26.62 
 
 		 299 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  31.65 
 
 		 278 aa  44.3  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.18 
 
 		 260 aa  43.9  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 244 aa  43.9  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>