46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6325 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  795    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  34.42 
 
 		 309 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 596 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  40 
 
 		 643 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  43.96 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  32.87 
 
 		 535 aa  67.4  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  35.79 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1151  hypothetical protein  27.73 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1495  hypothetical protein  28.66 
 
 		 220 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294905  normal  0.282523 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.59 
 
 		 764 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2861  hypothetical protein  38.3 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1454  methyltransferase type 11  37.65 
 
 		 197 aa  57  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.398758  normal  0.372191 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0954  hypothetical protein  32.18 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0297  hypothetical protein  28.3 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5204  methyltransferase type 11  33.14 
 
 		 301 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.521724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 194 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0334  methyltransferase type 11  26.18 
 
 		 223 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0297  hypothetical protein  28.3 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.541993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  38 
 
 		 1124 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0087  glycosyl transferase  34.82 
 
 		 712 aa  53.5  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4962  Methyltransferase type 11  29.34 
 
 		 222 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1396  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 		 242 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2283  hypothetical protein  25.67 
 
 		 213 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12981  hypothetical protein  38.1 
 
 		 172 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2663  hypothetical protein  29.87 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.236265 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1007  hypothetical protein  29.29 
 
 		 500 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2092  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 291 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.80059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.17 
 
 		 345 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0786  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 364 aa  50.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300568  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0052  hypothetical protein  26.15 
 
 		 172 aa  50.1  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000148856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4041  hypothetical protein  29.5 
 
 		 188 aa  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.692603 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3961  methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 200 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0335646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 266 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4072  methyltransferase type 11  31.38 
 
 		 197 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3850  Generic methyltransferase  31.72 
 
 		 197 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  35.11 
 
 		 172 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 238 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2592  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 201 aa  47  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5334  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 178 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2641  hypothetical protein  26.9 
 
 		 189 aa  47  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 257 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  30.06 
 
 		 974 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  35.29 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  25 
 
 		 216 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4068  hypothetical protein  27.85 
 
 		 678 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720614  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 254 aa  44.3  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>