16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0187 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0187  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  652    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0270  mannosyltransferase OCH1-related enzyme  61.92 
 
 
343 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0322  mannosyltransferase OCH1-related enzyme  55.03 
 
 
317 aa  342  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0318  hypothetical protein  36.94 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0266  hypothetical protein  40.55 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0203  hypothetical protein  38.87 
 
 
311 aa  159  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2764  hypothetical protein  29.45 
 
 
765 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.419382  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1521  mannosyltransferase OCH1 related enzyme  28.48 
 
 
233 aa  50.1  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000001768  normal  0.448905 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1243  glycosyltransferase  20.83 
 
 
331 aa  49.7  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000811632  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0087  glycosyl transferase  38.46 
 
 
712 aa  49.7  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533314  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2901  hypothetical protein  27.27 
 
 
292 aa  49.3  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000400572  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05461  capsule polysaccharide biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00130)  32.67 
 
 
399 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.584784  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2550  glycosyl transferase  28.71 
 
 
327 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1812  hypothetical protein  39.71 
 
 
204 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000930708 
 
 
-
 
NC_003296  RS00816  hypothetical protein  34.38 
 
 
457 aa  43.1  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.898614  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26056  predicted protein  24.69 
 
 
717 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.100829  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>