15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0270 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0270  mannosyltransferase OCH1-related enzyme  100 
 
 
343 aa  684    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0187  hypothetical protein  61.92 
 
 
325 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0322  mannosyltransferase OCH1-related enzyme  58.57 
 
 
317 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0318  hypothetical protein  38.2 
 
 
314 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0203  hypothetical protein  37.68 
 
 
311 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0266  hypothetical protein  41.67 
 
 
315 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2764  hypothetical protein  28.48 
 
 
765 aa  64.7  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.419382  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2901  hypothetical protein  26.62 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000400572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2550  glycosyl transferase  26.09 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1243  glycosyltransferase  28.57 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000811632  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05461  capsule polysaccharide biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00130)  30.7 
 
 
399 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.584784  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26056  predicted protein  25.16 
 
 
717 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.100829  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1812  hypothetical protein  36.36 
 
 
204 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000930708 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47110  predicted protein  25 
 
 
907 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0847586  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1521  mannosyltransferase OCH1 related enzyme  29.57 
 
 
233 aa  42.7  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000001768  normal  0.448905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>