26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2663 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2663  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  842    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.236265 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  31.76 
 
 		 535 aa  79.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 		 596 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  29.05 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.71 
 
 		 764 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  38.82 
 
 		 643 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  35.87 
 
 		 194 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2641  hypothetical protein  31.68 
 
 		 189 aa  53.9  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3799  hypothetical protein  26.45 
 
 		 220 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0954  hypothetical protein  31.46 
 
 		 196 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 278 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2861  hypothetical protein  32.61 
 
 		 192 aa  53.1  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  29.87 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 196 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  52.08 
 
 		 263 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1454  methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 197 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.398758  normal  0.372191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0087  glycosyl transferase  32.14 
 
 		 712 aa  47.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1495  hypothetical protein  22.22 
 
 		 220 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294905  normal  0.282523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  46.94 
 
 		 261 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  48.98 
 
 		 264 aa  46.6  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  53.06 
 
 		 248 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 		 711 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  47.92 
 
 		 259 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 710 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  48.98 
 
 		 248 aa  43.9  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>