24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0954 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0954  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1454  methyltransferase type 11  46.45 
 
 		 197 aa  181  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.398758  normal  0.372191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2861  hypothetical protein  42.47 
 
 		 192 aa  157  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0087  glycosyl transferase  36.56 
 
 		 712 aa  128  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2092  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 291 aa  88.6  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.80059  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  37.89 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2180  hypothetical protein  34.52 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.810913  hitchhiker  0.000154627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4068  hypothetical protein  25.62 
 
 		 678 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720614  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  32.18 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  36.26 
 
 		 535 aa  56.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 643 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2663  hypothetical protein  31.46 
 
 		 413 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.236265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 		 596 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3799  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.251695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 243 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.07 
 
 		 764 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0297  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.541993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0297  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2641  hypothetical protein  34.78 
 
 		 189 aa  41.6  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1396  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.94 
 
 		 242 aa  41.6  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1067  methyltransferase type 11  28.72 
 
 		 234 aa  41.2  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>