34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1454 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1454  methyltransferase type 11  100 
 
 
197 aa  408  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.398758  normal  0.372191 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0954  hypothetical protein  46.45 
 
 
196 aa  181  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2861  hypothetical protein  45.7 
 
 
192 aa  177  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0087  glycosyl transferase  37.91 
 
 
712 aa  124  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533314  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2092  Methyltransferase type 11  29.83 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.80059  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4068  hypothetical protein  38.38 
 
 
678 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720614  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  38.82 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2180  hypothetical protein  29.27 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.810913  hitchhiker  0.000154627 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  40.59 
 
 
643 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  37.65 
 
 
403 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 
596 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  35.71 
 
 
309 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.91 
 
 
764 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  37.35 
 
 
281 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3799  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 
204 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.251695 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2663  hypothetical protein  29.76 
 
 
413 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.236265 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
242 aa  47  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  32.97 
 
 
535 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
241 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3152  methyltransferase type 11  32.97 
 
 
254 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.23938  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  36.14 
 
 
278 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3615  methyltransferase type 11  37.38 
 
 
266 aa  45.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.134512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1396  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.29 
 
 
242 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  33.02 
 
 
243 aa  45.1  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  34.18 
 
 
306 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  34.57 
 
 
233 aa  42.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1067  methyltransferase type 11  31.34 
 
 
234 aa  42.4  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3845  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 
802 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.880485  normal  0.505849 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.02 
 
 
851 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  26.02 
 
 
851 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.02 
 
 
851 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.02 
 
 
851 aa  42  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.02 
 
 
851 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  30 
 
 
477 aa  42  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>