47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2180 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2180  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.810913  hitchhiker  0.000154627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3799  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 204 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.251695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2092  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.80059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0954  hypothetical protein  34.52 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0087  glycosyl transferase  32.73 
 
 		 712 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4068  hypothetical protein  33.98 
 
 		 678 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720614  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1454  methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.398758  normal  0.372191 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  44.58 
 
 		 596 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 274 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 255 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4962  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 281 aa  48.9  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1495  hypothetical protein  32.93 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294905  normal  0.282523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 		 710 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2861  hypothetical protein  33.67 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  32.14 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 282 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 341 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 278 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 310 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 332 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 328 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 328 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 328 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 711 aa  44.7  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  36.76 
 
 		 327 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  27.45 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2836  methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4072  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 351 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3850  Generic methyltransferase  31.58 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.39 
 
 		 325 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  37.88 
 
 		 324 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  35.35 
 
 		 309 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2283  hypothetical protein  31.67 
 
 		 213 aa  42  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 242 aa  42  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.72 
 
 		 236 aa  42  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 250 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  37.88 
 
 		 331 aa  41.6  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>