43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2283 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2283  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1151  hypothetical protein  41.38 
 
 
219 aa  170  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0334  methyltransferase type 11  42.93 
 
 
223 aa  170  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  25.12 
 
 
309 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1495  hypothetical protein  22.11 
 
 
220 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294905  normal  0.282523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  39.71 
 
 
281 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  25.67 
 
 
403 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4072  methyltransferase type 11  28.76 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3850  Generic methyltransferase  28.76 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  25.62 
 
 
278 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 
596 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  42.59 
 
 
1124 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1591  hypothetical protein  35.48 
 
 
379 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5204  methyltransferase type 11  28.69 
 
 
301 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.521724  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0632  hypothetical protein  35.59 
 
 
185 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12981  hypothetical protein  24.82 
 
 
172 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0508  hypothetical protein  35.09 
 
 
186 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2379  hypothetical protein  39.53 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.1 
 
 
853 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4041  hypothetical protein  25 
 
 
188 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.692603 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0749  hypothetical protein  31.43 
 
 
173 aa  44.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.4749  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
643 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2641  hypothetical protein  22.58 
 
 
189 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.45 
 
 
853 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.45 
 
 
853 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0534  hypothetical protein  23.74 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3184  hypothetical protein  39.53 
 
 
186 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2539  hypothetical protein  37.21 
 
 
186 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3961  methyltransferase type 11  22.83 
 
 
200 aa  42.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0335646  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  25.49 
 
 
851 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.49 
 
 
851 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.49 
 
 
851 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.49 
 
 
851 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3756  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 
393 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.49 
 
 
851 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2569  hypothetical protein  37.21 
 
 
186 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2311  hypothetical protein  37.21 
 
 
186 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2394  hypothetical protein  37.21 
 
 
186 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1050  hypothetical protein  29.85 
 
 
208 aa  42  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2180  hypothetical protein  31.67 
 
 
209 aa  42  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.810913  hitchhiker  0.000154627 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2582  hypothetical protein  37.21 
 
 
186 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000580379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  39.34 
 
 
266 aa  41.6  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  35 
 
 
226 aa  41.2  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>