14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1591 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1591  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  779    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0297  hypothetical protein  32.32 
 
 
299 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0297  hypothetical protein  31.94 
 
 
299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.541993  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4962  Methyltransferase type 11  36.92 
 
 
222 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
278 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  27.5 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
281 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
596 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0786  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300568  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2060  hypothetical protein  38 
 
 
216 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.572806  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2283  hypothetical protein  36.21 
 
 
213 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0334  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
223 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1151  hypothetical protein  43.24 
 
 
219 aa  43.1  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2592  Methyltransferase type 11  29 
 
 
201 aa  43.1  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>