More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0786 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0786  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 364 aa  741    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300568  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3961  methyltransferase type 11  53.98 
 
 		 200 aa  193  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0335646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2592  Methyltransferase type 11  53.41 
 
 		 201 aa  186  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3850  Generic methyltransferase  52.75 
 
 		 197 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4072  methyltransferase type 11  53.93 
 
 		 197 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5334  Methyltransferase type 11  46.2 
 
 		 178 aa  152  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1750  hypothetical protein  40.56 
 
 		 204 aa  142  9e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0534  hypothetical protein  39.33 
 
 		 208 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1050  hypothetical protein  39.38 
 
 		 208 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  32.82 
 
 		 725 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 808 aa  73.9  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 		 878 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.61 
 
 		 810 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  36.44 
 
 		 875 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 750 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  31.25 
 
 		 622 aa  66.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  32.46 
 
 		 816 aa  66.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 542 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 685 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 3145 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 637 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  33.33 
 
 		 545 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 681 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 739 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  33.04 
 
 		 865 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 543 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  32.52 
 
 		 864 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 909 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 583 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.48 
 
 		 632 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  31.58 
 
 		 550 aa  60.1  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 620 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 		 688 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 3172 aa  59.7  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  28.15 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1094 aa  59.7  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  36.04 
 
 		 626 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 		 1450 aa  59.7  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  27.2 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  36.09 
 
 		 747 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 1178 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 615 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 		 708 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 627 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.65 
 
 		 764 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.33 
 
 		 620 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0749  hypothetical protein  26.23 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.4749  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  23.53 
 
 		 529 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.14 
 
 		 626 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.14 
 
 		 614 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 626 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.14 
 
 		 626 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.14 
 
 		 614 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 614 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 614 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  33.6 
 
 		 594 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 1180 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 		 589 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  32.52 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 608 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 1049 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.95 
 
 		 1694 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 619 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 792 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 4489 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  30.33 
 
 		 887 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 235 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  30.63 
 
 		 795 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.3 
 
 		 745 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 		 974 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  28.57 
 
 		 514 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 3560 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.25 
 
 		 267 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 718 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.7 
 
 		 589 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 3035 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  29.77 
 
 		 594 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 576 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.57 
 
 		 603 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 649 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  28.45 
 
 		 661 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  31.71 
 
 		 725 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  30.5 
 
 		 587 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  26.28 
 
 		 780 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 366 aa  53.1  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 1827 aa  53.1  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 927 aa  52.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 762 aa  52.8  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 374 aa  52.8  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 		 363 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  29.6 
 
 		 585 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 602 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.46 
 
 		 837 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 634 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 573 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  30.94 
 
 		 615 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2641  hypothetical protein  27.21 
 
 		 189 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>