31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3961 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3961  methyltransferase type 11  100 
 
 
200 aa  414  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0335646  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2592  Methyltransferase type 11  68.69 
 
 
201 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1750  hypothetical protein  53.77 
 
 
204 aa  227  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0786  TPR repeat-containing protein  53.98 
 
 
364 aa  193  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300568  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4072  methyltransferase type 11  56.91 
 
 
197 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3850  Generic methyltransferase  56.35 
 
 
197 aa  187  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5334  Methyltransferase type 11  48.73 
 
 
178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0534  hypothetical protein  39.27 
 
 
208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1050  hypothetical protein  38.5 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  31.25 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2641  hypothetical protein  24.4 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  26.54 
 
 
535 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0052  hypothetical protein  28.21 
 
 
172 aa  55.1  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000148856  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0749  hypothetical protein  25.57 
 
 
173 aa  54.7  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.4749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
974 aa  52.4  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  29.82 
 
 
403 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3799  hypothetical protein  27.37 
 
 
220 aa  48.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  43.06 
 
 
511 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
281 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3799  Methyltransferase type 11  24.74 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.251695 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1151  hypothetical protein  24.38 
 
 
219 aa  42.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2283  hypothetical protein  22.83 
 
 
213 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 
262 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  32.98 
 
 
243 aa  42.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 
295 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  30.77 
 
 
244 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 
596 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
241 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  31.91 
 
 
309 aa  42  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 
208 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  28.16 
 
 
239 aa  41.2  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>