40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0534 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0534  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  425  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1050  hypothetical protein  88.78 
 
 
208 aa  373  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2592  Methyltransferase type 11  40.41 
 
 
201 aa  143  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3961  methyltransferase type 11  39.27 
 
 
200 aa  135  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0335646  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0786  TPR repeat-containing protein  39.33 
 
 
364 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300568  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3850  Generic methyltransferase  43.41 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4072  methyltransferase type 11  43.89 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1750  hypothetical protein  40.12 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5334  Methyltransferase type 11  42.14 
 
 
178 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  43.86 
 
 
281 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
974 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  31.11 
 
 
172 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.06 
 
 
851 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  32.06 
 
 
851 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 
996 aa  52.8  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.06 
 
 
851 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.06 
 
 
851 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.06 
 
 
851 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  30.77 
 
 
535 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0749  hypothetical protein  26.15 
 
 
173 aa  49.3  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.4749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.3 
 
 
853 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.3 
 
 
853 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.53 
 
 
853 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
750 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  30.91 
 
 
334 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0052  hypothetical protein  29.33 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000148856  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3844  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  42.86 
 
 
376 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2283  hypothetical protein  23.74 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  30.21 
 
 
251 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  28.21 
 
 
488 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 
262 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  29.35 
 
 
263 aa  42.4  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
310 aa  42  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0956  methyltransferase type 11  25.4 
 
 
262 aa  41.6  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  45.65 
 
 
207 aa  41.6  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3277  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
260 aa  41.6  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  33.75 
 
 
256 aa  41.2  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 
511 aa  41.2  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>