56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4072 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4072  methyltransferase type 11  100 
 
 		 197 aa  390  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3850  Generic methyltransferase  99.49 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3961  methyltransferase type 11  56.91 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0335646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2592  Methyltransferase type 11  57.93 
 
 		 201 aa  187  9e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0786  TPR repeat-containing protein  53.93 
 
 		 364 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300568  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5334  Methyltransferase type 11  55.87 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1750  hypothetical protein  47.25 
 
 		 204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1050  hypothetical protein  47.47 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0534  hypothetical protein  43.89 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2641  hypothetical protein  25.86 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12981  hypothetical protein  31.4 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  31.03 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  31.25 
 
 		 535 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  27.49 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 278 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2283  hypothetical protein  28.76 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  41.49 
 
 		 241 aa  51.6  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0749  hypothetical protein  25.19 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.4749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  31.38 
 
 		 403 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0052  hypothetical protein  25.29 
 
 		 172 aa  48.5  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000148856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  29.46 
 
 		 244 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 324 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 		 974 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  27.34 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  38.83 
 
 		 249 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2813  hypothetical protein  30.67 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00156648  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0334  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 276 aa  45.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.74 
 
 		 345 aa  44.7  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 243 aa  44.7  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2180  hypothetical protein  31.58 
 
 		 209 aa  44.7  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.810913  hitchhiker  0.000154627 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  48.89 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 511 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  47.17 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  40.32 
 
 		 643 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 274 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  37.33 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  28.12 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  28.3 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.41 
 
 		 764 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  25.93 
 
 		 290 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3799  hypothetical protein  25.26 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  25.93 
 
 		 290 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5204  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 301 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.521724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 244 aa  42  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  40.62 
 
 		 246 aa  41.6  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.91 
 
 		 291 aa  41.6  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3373  methyltransferase type 11  55.56 
 
 		 266 aa  41.6  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.104552 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 259 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  25.93 
 
 		 290 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  27.16 
 
 		 267 aa  41.2  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 1454 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>