More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0956 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0956  methyltransferase type 11  100 
 
 
262 aa  538  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  33.61 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
225 aa  62.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  30.38 
 
 
233 aa  62.4  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
1523 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
634 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 
235 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2417  hypothetical protein  42.86 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.320398  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  30.25 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.42 
 
 
250 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  25.13 
 
 
196 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1652  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 
279 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
222 aa  56.2  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
248 aa  55.8  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  26.23 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.61 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 
785 aa  55.8  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  25.68 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.44 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  31.68 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5480  methyltransferase type 12  29.22 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0807  methyltransferase type 11  25.83 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.45 
 
 
239 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  31.18 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.4 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  38.36 
 
 
274 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0467  methyltransferase type 11  42.62 
 
 
309 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  unclonable  0.0000104282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  31.93 
 
 
238 aa  52.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  31 
 
 
214 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
256 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
256 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2351  Methyltransferase type 11  48.89 
 
 
270 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  33.67 
 
 
213 aa  52  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  22.86 
 
 
219 aa  52  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05874  hypothetical protein  28.46 
 
 
284 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.813771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4394  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
265 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.62 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  33.62 
 
 
261 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  33.62 
 
 
261 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1695  methyltransferase type 11  26.44 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0925048  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.72 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.62 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.62 
 
 
261 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2221  Methyltransferase type 11  25.46 
 
 
314 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  31.82 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.62 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.8 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  41.51 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  35.44 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.65 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.05 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.48 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  30.4 
 
 
341 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.63 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0317  Methyltransferase type 12  32.03 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
237 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  22.16 
 
 
353 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  30.4 
 
 
332 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  30 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0846  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  31.48 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.48 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  28.18 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  36.14 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.9 
 
 
261 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 
1312 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3965  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.54 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2735  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  28.87 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0158342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  29.06 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1837  methyltransferase type 12  34.21 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.322151  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.51 
 
 
258 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32 
 
 
282 aa  50.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0761  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
198 aa  50.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.818805 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
310 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  44.68 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1147  methyltransferase type 12  36.46 
 
 
288 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.66 
 
 
254 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 
252 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  25.13 
 
 
239 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  25.5 
 
 
1162 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
263 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 
511 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
243 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.39 
 
 
255 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  23.91 
 
 
217 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  27.73 
 
 
260 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
243 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
220 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
243 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.22 
 
 
238 aa  49.3  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.69 
 
 
287 aa  48.9  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1178  methyltransferase type 11  25.17 
 
 
186 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.140989 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.58 
 
 
261 aa  49.3  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 
251 aa  48.9  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  30.09 
 
 
328 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9239  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.67 
 
 
263 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>