More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3275 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 511 aa  1053    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  32.11 
 
 		 280 aa  92.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14381  hypothetical protein  32.81 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  39.82 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  29.81 
 
 		 240 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 235 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  26.71 
 
 		 239 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 228 aa  72.8  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  40.59 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  23.86 
 
 		 254 aa  63.2  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 324 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 227 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  40 
 
 		 276 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  42.65 
 
 		 238 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 198 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  38.96 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  33.7 
 
 		 213 aa  57  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.94 
 
 		 764 aa  57  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2033  hypothetical protein  29.2 
 
 		 273 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  23.81 
 
 		 242 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  46.3 
 
 		 237 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  40.54 
 
 		 281 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  36.78 
 
 		 189 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1124 aa  54.7  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 		 1476 aa  54.7  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  55.32 
 
 		 197 aa  54.7  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.52 
 
 		 207 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  47.27 
 
 		 237 aa  54.3  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  48.98 
 
 		 331 aa  53.9  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 706 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  39.51 
 
 		 225 aa  53.9  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  43.64 
 
 		 241 aa  53.5  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  45.16 
 
 		 242 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 322 aa  53.5  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0866  hypothetical protein  30.11 
 
 		 224 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  34.29 
 
 		 194 aa  53.5  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  37.31 
 
 		 293 aa  53.5  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  45.31 
 
 		 267 aa  53.5  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3339  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 222 aa  53.5  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  44.44 
 
 		 507 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 244 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  43.33 
 
 		 293 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  45.83 
 
 		 341 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  46.97 
 
 		 658 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3644  methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 296 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  44.62 
 
 		 242 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  47.27 
 
 		 213 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 		 710 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  51.06 
 
 		 225 aa  52.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 233 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  29.17 
 
 		 233 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 214 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  42.59 
 
 		 255 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.43 
 
 		 207 aa  52  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  48.94 
 
 		 233 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 312 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  36.14 
 
 		 249 aa  52  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 238 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  45 
 
 		 237 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  48 
 
 		 248 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 237 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  25.9 
 
 		 216 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 281 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  30 
 
 		 258 aa  51.2  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.05 
 
 		 229 aa  50.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  44 
 
 		 353 aa  50.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  44 
 
 		 353 aa  50.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5480  methyltransferase type 12  45.1 
 
 		 245 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  52.08 
 
 		 262 aa  50.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 243 aa  50.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 248 aa  50.4  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2360  Methyltransferase type 11  43.14 
 
 		 201 aa  50.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175254  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2739  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  43.14 
 
 		 201 aa  50.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  50 
 
 		 256 aa  50.1  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  41.1 
 
 		 281 aa  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 309 aa  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 309 aa  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  42 
 
 		 206 aa  50.1  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  44 
 
 		 205 aa  50.1  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  35.23 
 
 		 279 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  44.23 
 
 		 276 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.99 
 
 		 280 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 284 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2401  methyltransferase type 11  53.49 
 
 		 208 aa  50.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0846  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 251 aa  49.7  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  45.28 
 
 		 284 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  51.16 
 
 		 194 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0956  methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 262 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  47.17 
 
 		 258 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  48.98 
 
 		 275 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  48.94 
 
 		 259 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  40.54 
 
 		 194 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.305357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>