14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1750 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1750  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  426  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3961  methyltransferase type 11  53.77 
 
 
200 aa  227  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0335646  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2592  Methyltransferase type 11  54.5 
 
 
201 aa  226  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4072  methyltransferase type 11  47.25 
 
 
197 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3850  Generic methyltransferase  46.7 
 
 
197 aa  160  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0786  TPR repeat-containing protein  40.56 
 
 
364 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300568  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5334  Methyltransferase type 11  38.55 
 
 
178 aa  136  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1050  hypothetical protein  40.12 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0534  hypothetical protein  40.12 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0052  hypothetical protein  33.85 
 
 
172 aa  61.6  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000148856  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  29.73 
 
 
172 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2641  hypothetical protein  25 
 
 
189 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12981  hypothetical protein  28.45 
 
 
172 aa  51.2  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  29.45 
 
 
974 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>