29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0297 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0297  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0297  hypothetical protein  98.66 
 
 
299 aa  621  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.541993  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1591  hypothetical protein  32.7 
 
 
379 aa  132  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  32.69 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
281 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
596 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  28.3 
 
 
403 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  32.22 
 
 
643 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0334  methyltransferase type 11  39.58 
 
 
223 aa  50.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 
222 aa  50.1  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  36.99 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2060  hypothetical protein  38.46 
 
 
216 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.572806  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4962  Methyltransferase type 11  40 
 
 
222 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0260  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
274 aa  45.8  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  43.48 
 
 
436 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  43.75 
 
 
345 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  30.68 
 
 
535 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
206 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0087  glycosyl transferase  26.62 
 
 
712 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533314  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2861  hypothetical protein  29.03 
 
 
192 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  36.17 
 
 
243 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16171  hypothetical protein  24.71 
 
 
287 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 
207 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 
207 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0954  hypothetical protein  33.33 
 
 
196 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
241 aa  42.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  31.37 
 
 
1124 aa  42.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  18.97 
 
 
513 aa  42.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>