20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1151 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1151  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2283  hypothetical protein  41.38 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0334  methyltransferase type 11  41.23 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  27.73 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  23.63 
 
 		 596 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 643 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  22.75 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 		 278 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2641  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1495  hypothetical protein  24.38 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294905  normal  0.282523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 281 aa  48.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2060  hypothetical protein  27.34 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.572806  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  24.86 
 
 		 535 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2592  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1591  hypothetical protein  43.24 
 
 		 379 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3961  methyltransferase type 11  24.38 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0335646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2765  hypothetical protein  27.03 
 
 		 308 aa  42.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  23.35 
 
 		 1673 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0786  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 364 aa  42  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300568  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>