22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1495 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1495  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  457  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294905  normal  0.282523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  32.52 
 
 
309 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 
596 aa  86.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  28.66 
 
 
403 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 
281 aa  58.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2283  hypothetical protein  22.11 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1151  hypothetical protein  24.38 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 
278 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2861  hypothetical protein  36.47 
 
 
192 aa  52  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  32.18 
 
 
643 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
226 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2180  hypothetical protein  32.93 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.810913  hitchhiker  0.000154627 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2663  hypothetical protein  22.22 
 
 
413 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.236265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  40.38 
 
 
1124 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4962  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3756  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
393 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  31.76 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  30.86 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0334  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
223 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  32.2 
 
 
373 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0297  hypothetical protein  29.85 
 
 
299 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.541993  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0297  hypothetical protein  28.36 
 
 
299 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>