More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2191 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  100 
 
 
226 aa  464  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3445  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
269 aa  99.4  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
477 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
351 aa  72.4  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  37 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.62 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1538  Generic methyltransferase  29.56 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  31.91 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  30.1 
 
 
442 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  26.9 
 
 
487 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
240 aa  64.3  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  24.12 
 
 
196 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  39.62 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
241 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  34.69 
 
 
373 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4425  methyltransferase type 11  30.82 
 
 
262 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102836  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  30.1 
 
 
442 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
255 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
237 aa  62  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.35 
 
 
236 aa  62  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
272 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  31.19 
 
 
272 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
208 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  32.54 
 
 
270 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  32.54 
 
 
270 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  32.54 
 
 
270 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
436 aa  59.7  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
237 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
239 aa  58.9  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1779  Methyltransferase type 11  27.01 
 
 
212 aa  58.9  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 
211 aa  58.9  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  31.13 
 
 
209 aa  58.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
1032 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  35.35 
 
 
236 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  32.8 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  23.5 
 
 
646 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  31.86 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.85 
 
 
345 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
289 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  31.78 
 
 
238 aa  57.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  32.8 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.13 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  32.17 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.2 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
634 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  31.73 
 
 
185 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.6 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  35.85 
 
 
213 aa  57  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
256 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
202 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0734  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 
264 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.599547  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
243 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
243 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
243 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 
242 aa  56.2  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  24.66 
 
 
279 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 
241 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
250 aa  55.8  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 
240 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 
295 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.84 
 
 
242 aa  55.5  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.6 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  29.63 
 
 
1635 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  29.9 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  24.29 
 
 
400 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.37 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
203 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  26.5 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  23.81 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
293 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.73 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.31 
 
 
238 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.7 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
232 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.88 
 
 
232 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  27.74 
 
 
358 aa  53.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  25.16 
 
 
276 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.63 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  35.35 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
232 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
232 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  23.7 
 
 
300 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  34.78 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  32.99 
 
 
382 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>