131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0365 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  100 
 
 		 243 aa  478  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  89.21 
 
 		 241 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4068  hypothetical protein  36.27 
 
 		 678 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720614  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2180  hypothetical protein  34.65 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.810913  hitchhiker  0.000154627 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2092  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.80059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  40.22 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3799  Methyltransferase type 11  30.33 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.251695 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  43.84 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  39.56 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 596 aa  55.5  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  48.08 
 
 		 1124 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2088  hypothetical protein  28.24 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  40.66 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0958  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 279 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  43.48 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.21 
 
 		 345 aa  52.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  39.13 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.9 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2465  hypothetical protein  42.86 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16743  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  32.94 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4962  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2861  hypothetical protein  32.67 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  34.57 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0264  Methyltransferase type 11  43.86 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  29.78 
 
 		 442 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 477 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 233 aa  48.9  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14381  hypothetical protein  22.31 
 
 		 239 aa  48.5  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.79 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  34.18 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  27.16 
 
 		 643 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  34 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  40.35 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0087  glycosyl transferase  37.5 
 
 		 712 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2867  Methyltransferase type 11  40.21 
 
 		 355 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  42.65 
 
 		 261 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  37.63 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  32.64 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0954  hypothetical protein  31.68 
 
 		 196 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.99 
 
 		 256 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 		 1106 aa  45.4  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 259 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  36.99 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  48.89 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1454  methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.398758  normal  0.372191 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4072  methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0297  hypothetical protein  38.3 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.541993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  37.88 
 
 		 710 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.99 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.99 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  36.62 
 
 		 415 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.99 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1495  hypothetical protein  30.86 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294905  normal  0.282523 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 436 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3850  Generic methyltransferase  38.3 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  29.91 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2836  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 		 711 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0260  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  37.31 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  36.99 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.36 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  46.67 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  38.03 
 
 		 207 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  39.56 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  36.99 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  32.05 
 
 		 668 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2992  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.547914  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  32.22 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 1082 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0297  hypothetical protein  36.17 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  42.31 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  33 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  24.48 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5464  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2060  hypothetical protein  33.71 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.572806  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 351 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 1739 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  26.04 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 352 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1007  hypothetical protein  31.58 
 
 		 500 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  44 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  41.38 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 442 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3307  Methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 300 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5795  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 293 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>