28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0334 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0334  methyltransferase type 11  100 
 
 
223 aa  465  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2283  hypothetical protein  42.93 
 
 
213 aa  170  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1151  hypothetical protein  41.23 
 
 
219 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  31.2 
 
 
643 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 
596 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
281 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  36.76 
 
 
278 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  26.18 
 
 
403 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5204  methyltransferase type 11  32 
 
 
301 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.521724  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  23.48 
 
 
309 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0297  hypothetical protein  41.67 
 
 
299 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.541993  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  39.62 
 
 
1124 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0297  hypothetical protein  39.58 
 
 
299 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2060  hypothetical protein  39.62 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.572806  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1591  hypothetical protein  37.5 
 
 
379 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  39.68 
 
 
274 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4072  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
197 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4041  hypothetical protein  24.17 
 
 
188 aa  45.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.692603 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3850  Generic methyltransferase  28.12 
 
 
197 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4962  Methyltransferase type 11  25.6 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  35.92 
 
 
710 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12981  hypothetical protein  27.87 
 
 
172 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1495  hypothetical protein  27.08 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294905  normal  0.282523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  27.94 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  35.92 
 
 
711 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  31.87 
 
 
254 aa  42.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  24.86 
 
 
282 aa  41.6  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>